Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms