Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul3Q9JLV5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms