Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cd2apQ9JLQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd2apQ9JLQ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms