Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms