Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr10Q9JL21 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr10Q9JL21 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr10Q9JL21 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms