Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk3aQ9JKX8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms