Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1aQ9JKU8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms