Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole3Q9JKP7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole3Q9JKP7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole3Q9JKP7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole3Q9JKP7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole3Q9JKP7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pole3Q9JKP7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms