Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms