Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
AtrQ9JKK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms