Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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Tmod2Q9JKK7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Tmod2Q9JKK7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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Tmod2Q9JKK7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Tmod2Q9JKK7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Tmod2Q9JKK7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Tmod2Q9JKK7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod2Q9JKK7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms