Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms