Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms