Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PigbQ9JJQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PigbQ9JJQ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PigbQ9JJQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PigbQ9JJQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PigbQ9JJQ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PigbQ9JJQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms