Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efcc1Q9JJF6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efcc1Q9JJF6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms