Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms