Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FliiQ9JJ28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms