Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EefsecQ9JHW4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EefsecQ9JHW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EefsecQ9JHW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EefsecQ9JHW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EefsecQ9JHW4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EefsecQ9JHW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
EefsecQ9JHW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms