Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp6Q9ESX2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp6Q9ESX2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms