Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms