Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms