Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrnb2Q9ERK7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms