Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms