Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms