Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms