Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1lQ9EQ00 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms