Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms