Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms