Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms