Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1bQ9EPL6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms