Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp1aQ9EPL5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp1aQ9EPL5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms