Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn1Q9EPL2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms