Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr88Q9EPB7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms