Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms