Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms