Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms