Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak1ip1Q9DCE5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pak1ip1Q9DCE5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms