Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms