Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ftsj3Q9DBE9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1120 ms