Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.5 ms