Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms