Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms