Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D9H8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D9H8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D9H8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D9H8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms