Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cntd1Q9D995 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntd1Q9D995 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms