Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx5Q9D8U8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms