Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med11Q9D8C6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med11Q9D8C6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med11Q9D8C6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med11Q9D8C6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med11Q9D8C6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med11Q9D8C6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms