Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jam3Q9D8B7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms