Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
U2af1Q9D883 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1Q9D883 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms