Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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