Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms